Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRM2P04554 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRM2P04554 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRM2P04554 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRM2P04554 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRM2P04554 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRM2P04554 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRM2P04554 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRM2P04554 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRM2P04554 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRM2P04554 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRM2P04554 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRM2P04554 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRM2P04554 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRM2P04554 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms