Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL10P02778 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CXCL10P02778 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CXCL10P02778 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms