Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC3P02656 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC3P02656 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOC3P02656 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOC3P02656 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOC3P02656 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms