Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC2P02655 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC2P02655 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC2P02655 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC2P02655 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC2P02655 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC2P02655 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC2P02655 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC2P02655 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC2P02655 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC2P02655 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC2P02655 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOC2P02655 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOC2P02655 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC2P02655 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC2P02655 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC2P02655 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC2P02655 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC2P02655 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC2P02655 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC2P02655 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC2P02655 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC2P02655 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms