Protein–RNA interactions for Protein: P01834

IGKC, Immunoglobulin kappa constant, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKCP01834 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKCP01834 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKCP01834 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IGKCP01834 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IGKCP01834 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IGKCP01834 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IGKCP01834 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IGKCP01834 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IGKCP01834 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKCP01834 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKCP01834 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKCP01834 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGKCP01834 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms