Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRBV12-3P01733 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRBV12-3P01733 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRBV12-3P01733 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms