Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POMCP01189 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
POMCP01189 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
POMCP01189 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POMCP01189 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMCP01189 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
POMCP01189 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMCP01189 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMCP01189 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMCP01189 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
POMCP01189 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
POMCP01189 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
POMCP01189 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMCP01189 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMCP01189 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POMCP01189 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMCP01189 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMCP01189 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMCP01189 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMCP01189 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMCP01189 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMCP01189 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POMCP01189 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POMCP01189 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POMCP01189 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POMCP01189 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
POMCP01189 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMCP01189 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POMCP01189 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms