Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ASS1P00966 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASS1P00966 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASS1P00966 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASS1P00966 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASS1P00966 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASS1P00966 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASS1P00966 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASS1P00966 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASS1P00966 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASS1P00966 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASS1P00966 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASS1P00966 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ASS1P00966 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASS1P00966 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASS1P00966 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASS1P00966 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASS1P00966 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASS1P00966 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ASS1P00966 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ASS1P00966 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASS1P00966 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ASS1P00966 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASS1P00966 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASS1P00966 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASS1P00966 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ASS1P00966 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASS1P00966 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ASS1P00966 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ASS1P00966 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms