Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR4O95977 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR4O95977 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms