Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEC24BO95487 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC24BO95487 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC24BO95487 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms