Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN9O95484 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN9O95484 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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