Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBOX1O75936 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BBOX1O75936 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms