Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CSDE1O75534 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSDE1O75534 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSDE1O75534 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms