Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN11O75508 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN11O75508 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms