Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEC22BO75396 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms