Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFYO75367 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFYO75367 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFYO75367 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFYO75367 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2AFYO75367 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2AFYO75367 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFYO75367 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFYO75367 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFYO75367 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2AFYO75367 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms