Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PPFIA3O75145 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPFIA3O75145 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPFIA3O75145 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms