Protein–RNA interactions for Protein: O75132

ZBED4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4O75132 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZBED4O75132 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZBED4O75132 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED4O75132 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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