Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF5BO60841 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF5BO60841 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
EIF5BO60841 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EIF5BO60841 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EIF5BO60841 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EIF5BO60841 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EIF5BO60841 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EIF5BO60841 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF5BO60841 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF5BO60841 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
EIF5BO60841 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF5BO60841 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms