Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ATP10AO60312 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ATP10AO60312 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms