Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT86O43790 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT86O43790 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT86O43790 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT86O43790 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT86O43790 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT86O43790 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT86O43790 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT86O43790 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT86O43790 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT86O43790 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT86O43790 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT86O43790 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT86O43790 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT86O43790 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT86O43790 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT86O43790 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT86O43790 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT86O43790 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT86O43790 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT86O43790 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT86O43790 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT86O43790 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KRT86O43790 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT86O43790 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT86O43790 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT86O43790 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT86O43790 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT86O43790 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT86O43790 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT86O43790 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT86O43790 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms