Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYNGR2O43760 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYNGR2O43760 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms