Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKAB2O43741 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKAB2O43741 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms