Protein–RNA interactions for Protein: O43561

LAT, Linker for activation of T-cells family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATO43561 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LATO43561 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LATO43561 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LATO43561 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LATO43561 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LATO43561 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LATO43561 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LATO43561 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LATO43561 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LATO43561 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LATO43561 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LATO43561 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LATO43561 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LATO43561 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LATO43561 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LATO43561 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LATO43561 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LATO43561 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LATO43561 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LATO43561 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LATO43561 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LATO43561 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LATO43561 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LATO43561 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LATO43561 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LATO43561 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LATO43561 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LATO43561 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LATO43561 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LATO43561 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LATO43561 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LATO43561 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LATO43561 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LATO43561 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LATO43561 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LATO43561 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LATO43561 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LATO43561 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LATO43561 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LATO43561 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LATO43561 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LATO43561 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LATO43561 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LATO43561 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LATO43561 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LATO43561 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LATO43561 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LATO43561 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LATO43561 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LATO43561 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LATO43561 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LATO43561 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LATO43561 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms