Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CBFA2T2O43439 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBFA2T2O43439 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms