Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TBX1O43435 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TBX1O43435 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TBX1O43435 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TBX1O43435 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TBX1O43435 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TBX1O43435 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TBX1O43435 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TBX1O43435 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms