Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTIFO43310 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTIFO43310 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTIFO43310 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTIFO43310 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTIFO43310 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTIFO43310 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTIFO43310 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTIFO43310 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTIFO43310 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTIFO43310 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTIFO43310 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTIFO43310 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTIFO43310 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTIFO43310 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTIFO43310 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTIFO43310 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTIFO43310 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTIFO43310 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTIFO43310 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTIFO43310 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTIFO43310 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTIFO43310 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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