Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHGDHO43175 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHGDHO43175 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms