Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCF2LO15068 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2LO15068 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2LO15068 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms