Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HSPB6O14558 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HSPB6O14558 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms