Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KPNA3O00505 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KPNA3O00505 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KPNA3O00505 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms