Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELL2O00472 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELL2O00472 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELL2O00472 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELL2O00472 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELL2O00472 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELL2O00472 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ELL2O00472 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ELL2O00472 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ELL2O00472 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ELL2O00472 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ELL2O00472 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ELL2O00472 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ELL2O00472 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELL2O00472 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELL2O00472 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELL2O00472 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ELL2O00472 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ELL2O00472 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ELL2O00472 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ELL2O00472 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ELL2O00472 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ELL2O00472 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ELL2O00472 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ELL2O00472 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELL2O00472 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELL2O00472 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELL2O00472 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELL2O00472 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELL2O00472 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELL2O00472 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ELL2O00472 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ELL2O00472 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ELL2O00472 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ELL2O00472 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ELL2O00472 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ELL2O00472 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ELL2O00472 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ELL2O00472 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ELL2O00472 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ELL2O00472 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ELL2O00472 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ELL2O00472 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELL2O00472 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELL2O00472 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELL2O00472 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ELL2O00472 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms