Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOC4-APOC2K7ER74 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOC4-APOC2K7ER74 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms