Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms