Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PBE3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PBE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PBE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PBE3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PBE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PBE3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PBE3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PBE3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PBE3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PBE3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PBE3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PBE3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PBE3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PBE3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PBE3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PBE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PBE3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PBE3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PBE3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PBE3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms