Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L20D6RJB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP17L20D6RJB6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP17L20D6RJB6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L20D6RJB6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L20D6RJB6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP17L20D6RJB6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms