Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9IYK1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9IYK1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9IYK1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9IYK1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9IYK1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9IYK1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9IYK1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9IYK1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9IYK1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C9IYK1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9IYK1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9IYK1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9IYK1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9IYK1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9IYK1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9IYK1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9IYK1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9IYK1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9IYK1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9IYK1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9IYK1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9IYK1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9IYK1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9IYK1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9IYK1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9IYK1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9IYK1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C9IYK1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9IYK1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9IYK1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9IYK1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9IYK1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9IYK1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9IYK1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9IYK1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9IYK1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9IYK1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9IYK1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9IYK1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9IYK1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9IYK1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9IYK1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9IYK1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9IYK1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C9IYK1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9IYK1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9IYK1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C9IYK1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9IYK1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C9IYK1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms