Protein–RNA interactions for Protein: B9A6J9

TBC1D3L, TBC1 domain family member 3L, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3LB9A6J9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TBC1D3LB9A6J9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TBC1D3LB9A6J9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBC1D3LB9A6J9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms