Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SOBPA7XYQ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SOBPA7XYQ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOBPA7XYQ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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