Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTLL13PA6NNM8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTLL13PA6NNM8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms