Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GOLGA8JA6NMD2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GOLGA8JA6NMD2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms