Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RRN3P2A6NIE6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRN3P2A6NIE6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRN3P2A6NIE6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms