Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL33A6NCF5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL33A6NCF5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL33A6NCF5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms