Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN7

FAM149A, Protein FAM149A, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149AA5PLN7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM149AA5PLN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM149AA5PLN7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms