Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAB19A4D1S5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAB19A4D1S5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms