Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms