Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AL512288.2-201ENST00000426041 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PCDH10Q9P2E7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC016598.1-201ENST00000340585 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PCDH10Q9P2E7 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PCDH10Q9P2E7 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PCDH10Q9P2E7 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 NIFK-AS1-202ENST00000414554 1411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCDH10Q9P2E7 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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