Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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COL20A1Q9P218 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL20A1Q9P218 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL20A1Q9P218 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL20A1Q9P218 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL20A1Q9P218 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COL20A1Q9P218 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL20A1Q9P218 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL20A1Q9P218 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL20A1Q9P218 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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