Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms