Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PARD6AQ9NPB6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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